921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd Ifremer sextant@ifremer.fr pointOfContact 2025-05-15T23:20:20.664601Z ISO 19115-3 - SEXTANT 1.0 WGS 84 (EPSG:4326) EPSG 8.6 DCSMM2018 - HP - D1C6 - Ratio de la concentration de surface en chlorophylle a contenue dans les dinoflagellés sur celle contenue dans les diatomées (2012-2016) 2018 creation DCSMM2018_CNRS_HP_D1C6_CHLOROPHYLLE_A_RATIO DOI:10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd Le critère de définition du bon état écologique pour le descripteur D1 – Habitats pélagiques est le critère D1C6 : « les caractéristiques du type d'habitat, notamment sa structure biotique et abiotique et ses fonctions, ne subissent pas d'effets néfastes dus à des pressions anthropiques ». Un des indicateurs retenus, développés pour les communautés phyto- et zooplanctoniques, est l’indicateur PH1, basé sur la dynamique comparée de groupes fonctionnels (ou paires de formes de vie). Les échelles d’évaluation géographiques considérées sont les masses d’eau côtières de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) à la côte et les paysages marins mensuels au large, combinés sur une seule couche annuelle pour les besoins de l’évaluation. Le PH1 est en cours de développement et d’adaptation aux données disponibles dans les SRM, la période de référence et les seuils restent à définir pour cet indicateur. L’évaluation du bon état écologique n’a donc pu être effectué pour ce premier cycle DCSMM. Les données sont présentées sous la forme de fichiers géoréférencés de type shapefile. CNRS Marie Duflos CNRS marie.duflos@log.cnrs.fr author Guillaume Wacquet CNRS author Anaïs Aubert CNRS author Isabelle Rombouts CNRS author Benoit Mialet CNRS author David Devreker Ifremer David.Devreker@ifremer.fr author Alain Lefebvre Ifremer Alain.Lefebvre@ifremer.fr author Luis Felipe Artigas CNRS felipe.artigas@univ-littoral.fr author Ifremer +33 (0)2 98.22.49.16 +33 (0)2 98.22.46.44 IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 PLOUZANE 29280 France sismer@ifremer.fr http://www.ifremer.fr/sismer/ web site publisher https://sextant.ifremer.fr/geonetwork/srv/api/records/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd/attachments/vignette.JPG /Milieu chimique/Colonne d'eau Thèmes Sextant 2019-01-28 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.sextant-theme Répartition des espèces GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 2018-07-27 publication geonetwork.thesaurus.external.theme.httpinspireeceuropaeutheme-theme évaluation bon état écologique chlorophylle habitat pélagique Données ouvertes D1: Biodiversité - Habitats pélagiques DCSMM : Descripteurs 2020-04-09 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.dcsmm-descripteur /Métropole/Golfe de Gascogne /Métropole/Manche mer du Nord Sous-regions marines 2019-10-16 publication geonetwork.thesaurus.local.place.dcsmm.area Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM) Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM) Cadre Réglementaire - SIMM 2019-10-16 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.simm.reglementaire /Etat du Milieu/Biogéochimie Thématiques - SIMM 2019-12-19 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.simm.thematiques Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/ vector 100000 utf8 biota -11.50 13.50 38.40 52.10 2012 2016 https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MC_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MC_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique FILE MC_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique https://doi.org/10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd DOI DOI du jeu de données DOI du jeu de données https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MMN_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MMN_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord FILE MMN_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS GdG_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS GdG_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne FILE GdG_trimestre1 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MC_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MC_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique FILE MC_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MMN_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MMN_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord FILE MMN_trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS GdG-trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS GdG-trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne FILE GdG-trimestre2 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Avril-Juin) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MC_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MC_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique FILE MC_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MMN_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MMN_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord FILE MMN_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS GdG_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS GdG_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne FILE GdG_trimestre3 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MC_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MC_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique FILE MC_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS MMN_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS MMN_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord FILE MMN_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord https://sextant.ifremer.fr/services/wms/dcsmm2018_indicateurs OGC:WMS GdG_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne https://sextant.ifremer.fr/services/wfs/dcsmm2018_indicateurs OGC:WFS GdG_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne FILE GdG_trimestre4 Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne RÈGLEMENT (UE) N o 1089/2010 DE LA COMMISSION du 23 novembre 2010 portant modalités d'application de la directive 2007/2/CE du Parlement européen et du Conseil en ce qui concerne l'interopérabilité des séries et des services de données géographiques 2010-12-08 publication See the referenced specification Les indicateurs pour l’évaluation du bon état écologique des habitats pélagiques, ont été développés dans le cadre de la convention OSPAR par le groupe de travail « Intersessional Correspondence Group - Coordination of Biodiversity Assessment and Monitoring » (ICG-COBAM. L’indicateur PH1 est basé sur la méthode du Plankton Index (PI, Gowen et al., 2013 ; Tett et al., 2013). En raison du manque de données complètes par paire de groupes fonctionnels et de la difficulté d’accessibilité de son script, le PH1 n’a pu être évalué pour l’évaluation 2018. En complément, une approche parallèle au PH1 (ratios à partir de données pigmentaires extraites à partir de la modélisation) a pu être proposée, pour une des paires de groupes fonctionnels, de façon à couvrir les différentes SRM. Cette approche n’est pas destinée à être généralisée à l’avenir, ni à remplacer le PH1. Elle est présentée à titre d’exemple, afin d’illustrer le potentiel de ce type de données pour renseigner un des couples fonctionnels (dinoflagellés/diatomées) qui permettront de calculer le PH1. Le calcul de ce rapport dinoflagellés/diatomées s’est fait via la concentration en chlorophylle a. à partir des données issues de la modélisation par le modèle ECO-MARS3D ; par trimestre pour rendre compte de la phénologie des groupes d'espèces considérés. La métrique choisie est le percentile 90 de la concentration en chlorophylle a de chacun de ces groupes. Ce processus s’est fait au moyen de scripts informatiques écrits en langage R (https://cran.r-project.org/), il se passe en plusieurs étapes (Figure 4) : 1-Traitement des données de campagnes mesurées in situ pour obtenir des matrices géoréférencées. 2-Compilation de toutes les matrices (sous forme de raster NetCDF) comprises dans chaque trimestre pour la période d'évaluation (2012-2016). 3-Extraction des données (dinoflagellés et diatomées) de surface contenues dans chacune des UGE. 4-Calcul du percentile 90 par trimestre dans chacune de ces UGE pour synthétiser l’information à une échelle plus propice à l’interprétation et compatible avec le calcul des indicateurs. 5-Calcul du rapport dinoflagellés / diatomées par UGE