446b5602-a4e8-4c2f-a7c4-2f6e77ed4317 Carrier Gregory IFREMER 02 40 37 42 61 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Gregory.Carrier@ifremer.fr pointOfContact 2025-12-13T13:24:14.038875Z ISO 19115-3 - SEXTANT ISO 19115-3 - SEXTANT 1.0 WGS 84 (EPSG:4326) EPSG 8.6 Genetic and phenotypic intra-species diversity of alga Tisochrysis lutea Genetic and phenotypic intra-species diversity of alga Tisochrysis lutea Séquençage du génome de 14 souches de l’algue Tisochrysis lutea 2017-04-01 creation 2018-01-29 publication FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_DIVTISO_2017 The eleven collected wild strains of T. lutea were compared phenotypically, in particular with regard to their pigment and lipid profiles. The genome of each T. lutea strain was also sequenced to investigate the genetic structure and genome organisation of this species. Collected data were summarized in a genome browser to provide easy-to-use support for the scientific community (https://genomes-catalog.ifremer.fr). This provides an important resource- to understand, exploit and predict the biodiversity of this species. Ifremer - Laboratoire Physiologie et Biotechnologie des Algues - Projet DynAlgue Carrier Gregory IFREMER 02 40 37 42 61 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Gregory.Carrier@ifremer.fr author Berthelier Jeremy IFREMER 02 40 37 40 66 02 40 37 40 73 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Jeremy.Berthelier@ifremer.fr author Maupetit Agathe IFREMER 02 40 37 40 30 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Agathe.Maupetit@ifremer.fr author Nicolau Elodie IFREMER Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Elodie.Nicolau@ifremer.fr author Marbouty Martial Institut Pasteur martial.marbouty@pasteur.fr author Schreiber Nathalie IFREMER Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Nathalie.Schreiber@ifremer.fr author Charrier Aurelie IFREMER 02 40 37 41 26 02 40 37 42 41 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Aurelie.Charrier@ifremer.fr author Carcopino Clémence IFREMER Clemence.Carcopino@ifremer.fr author Leroi Laura IFREMER Clemence.Carcopino@ifremer.fr author Saint-Jean Bruno IFREMER 02 40 37 42 52 02 40 37 42 41 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Nantes France France France Bruno.Saintjean@ifremer.fr author Laboratoire Physiologie et Biotechnologie des Algues IFREMER originator IFREMER +33 (0)2 98.22.49.16 +33 (0)2 98.22.46.44 IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 PLOUZANE 29280 France France France sismer@ifremer.fr http://data.ifremer.fr/SISMER http://data.ifremer.fr/SISMER web site publisher https://sextant.ifremer.fr/geonetwork/srv/api/records/446b5602-a4e8-4c2f-a7c4-2f6e77ed4317/attachments/BioinfoMarine.png Habitats and biotopes Habitats and biotopes Habitats et biotopes Habitats and biotopes Habitats and biotopes Habitats et biotopes Habitats and biotopes Habitats and biotopes Habitats et biotopes Habitats and biotopes Habitats and biotopes Habitats et biotopes GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 GEMET - INSPIRE themes, version 1.0 2018-07-27T14:39:48 publication 2018-07-27 publication geonetwork.thesaurus.external.theme.httpinspireeceuropaeutheme-theme /Biological Environment/Bioinformatics /Biological Environment/Bioinformatics /Milieu biologique/Bio-Informatique /Biological Environment/Bioinformatics /Biological Environment/Bioinformatics /Milieu biologique/Bio-Informatique /Biological Environment/Bioinformatics /Biological Environment/Bioinformatics /Milieu biologique/Bio-Informatique /Biological Environment/Bioinformatics /Biological Environment/Bioinformatics /Milieu biologique/Bio-Informatique Thèmes Sextant Thèmes Sextant 2025-12-09 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.sextant-theme Variables ODATIS Variables ODATIS 2023-10-13 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.odatis_variables Bioinformatics Bioinformatics Bioinformatique ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names 2025-07-29 publication geonetwork.thesaurus.external.theme.NVS.OD1 Analysis data Analysis data Données d'analyse Type de jeux de donnée ODATIS Type de jeux de donnée ODATIS 2025-12-09 publication geonetwork.thesaurus.local.theme.type_jeux_donnee Open Licence Open Licence Licence Ouverte utf8 environment -180.00 180.00 -90.00 90.00 /home/ref-bioinfo-public/ifremer/phytox/pangenomeTiso /home/ref-bioinfo-public/ifremer/phytox/pangenomeTiso NETWORK:LINK https://data-dataref.ifremer.fr/bioinfo/ifremer/phytox/pangenomeTiso/ https://data-dataref.ifremer.fr/bioinfo/ifremer/phytox/pangenomeTiso/ WWW:DOWNLOAD Lien de téléchargement Lien de téléchargement Lien de téléchargement Lien de téléchargemen https://doi.org/10.12770/446b5602-a4e8-4c2f-a7c4-2f6e77ed4317 https://doi.org/10.12770/446b5602-a4e8-4c2f-a7c4-2f6e77ed4317 DOI Digital Object Identifier (DOI) This study is the first step in the characterization of intra-species diversity in Tisochrysis lutea which remains a huge knowledge gap relative to this species importance as a microalga of biotechnological interest.