• Catalogue PIGMA
  •  
  •  
  •  

Densité pluriannuelle et variance de krigeage de l'espèce Pagellus acarne aux stades juvénile et adulte dans le Golfe du Lion (MEDITS, moyenne 1994-2019)

La densité (nombre individus/km²) a été calculée annuellement à partir des données de la campagne MEDITS entre 1994 et 2019 puis a été moyennée par station sur cette période. Les données ont été transformées par logarithme décimal log10 (x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été effectués pour interpoler les données dans le Golfe du Lion. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.

Simple

Date (Creation)
2020-08-10
Identifier
DOI:10.12770/6ee09862-534b-4f49-ae75-8ab167b93f07
Credit
Ifremer - Eolien flottant A06
Point of contact
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Point of contact
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
Author
  IFREMER - De Rock Pauline
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sète , France
Author
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Author
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
Publisher
  Ifremer
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Répartition des espèces
Sous-regions marines
  • /Métropole/Méditerranée occidentale
Eolien - Jeu de données
  • Medits
Eolien - Type
  • Densité
  • Variance de krigeage
Eolien - Groupe
  • Ichtyofaune
Eolien - Stade
  • Juvénile
  • Adulte
SIH - Espèces scientifiques
  • Pagellus acarne
Use limitation
CC-BY-NC-SA (Creative Commons - Attribution, Pas d’utilisation commerciale, Partage dans les mêmes conditions)
Access constraints
Copyright
Use constraints
Copyright
Spatial representation type
grid Grid
Distance
0.05  meter
Metadata language
Français
Character set
utf8 UTF8
Topic category
  • Oceans
N
S
E
W
thumbnail


Begin date
1994-01-01
End date
2019-12-31
Unique resource identifier
EPSG:4326
Number of dimensions
1
Dimension name
Vertical
Dimension size
1640
Cell geometry
Area
Transformation parameter availability
No
Distribution format
  • ( )

OnLine resource
DOI du jeu de données ( DOI )

DOI du jeu de données

OnLine resource
Source 1 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Campillo, 1992 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Source 2 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Krstulović-Šifner & Vrgoc, 2009 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Serrat et al., 2019 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Mir-Arguimbau et al., 2020 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Velasco et al., 2011 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Mytilineou et al., 2013 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Busalacchi et al., 2014 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Arculeo et al., 2014 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Rotllant et al., 2002 ( WWW:LINK )
OnLine resource
Campagne MEDITS ( WWW:LINK )
OnLine resource
The MEDITS Project ( WWW:LINK )
OnLine resource
Densite_pluriannuelle_1994_2019_PAGEACA ( WWW:DOWNLOAD )

Densité pluriannuelle et variance de krigeage

OnLine resource
Densite_pluriannuelle_1994_2019_PAGEACA_ADULT ( OGC:WMS )

Densité pluriannuelle - stade adulte

OnLine resource
Densite_pluriannuelle_1994_2019_PAGEACA_JUV ( OGC:WMS )

Densité pluriannuelle - stade juvénile

OnLine resource
SD_Densite_pluriannuelle_1994_2019_PAGEACA_ADULT ( OGC:WMS )

Variance de krigeage pluriannuelle - stade adulte

OnLine resource
SD_Densite_pluriannuelle_1994_2019_PAGEACA_JUV ( OGC:WMS )

Variance de krigeage pluriannuelle - stade juvénile

Hierarchy level
Dataset

Domain consistency

Conformance result

Date (Publication)
2010-12-08
Explanation
See the referenced specification
Statement

La campagne MEDITS est une campagne de chalutage de fond standardisée et coordonnée à l'échelle internationale ciblant les ressources démersales et benthiques en mer Méditerranée et qui se déroule tous les ans au printemps depuis 1994. Chaque année, 65 stations fixes sont échantillonnées en moyenne dans le Golfe du Lion. L’identification de chaque individu capturé dans les traits de chalut est réalisée au niveau spécifique puis les poids et le nombre d'individus par espèce sont déterminés. La taille, le sexe et la maturité sont récoltés quand cela est prévu en fonction du protocole défini pour chaque espèce.

Les espèces possédant une occurrence moyenne supérieure ou égale à 20% sur la période 1994-2019 ont bénéficié d'une cartographie pluriannuelle (distribution moyenne sur l’ensemble de la période).

Une préparation des données a été préalablement effectuée avant la création des cartes de distribution. Le calcul de la surface balayée par trait de chalut a été effectué afin de calculer la densité totale (nombre individus/km²) par station, par année et par espèce. La densité a ensuite été moyennée par station et par espèce sur la période d'étude. Les moyennes des latitudes et longitudes ont été calculées par trait de chalut. De façon à travailler dans un système orthonormé, la longitude a été transformée (Lon*cos(Lat*pi/180)).

Pour les espèces bénéficiant d'au moins 80% d’observations de la distribution en taille sur l’ensemble des observations disponibles, la différenciation entre les juvéniles et les adultes a été effectuée. Les stades de maturité sont échantillonnés pour certaines espèces lors de la campagne MEDITS ce qui nous a permis de distinguer dans les données les individus matures et non matures. Dans le but de déterminer la taille à laquelle les espèces atteignent leur maturité sexuelle, une régression logistique a été utilisée pour étudier la relation entre le stade de maturité et la taille des individus. Ce type de modèle relie le statut de maturité (un facteur bimodal) à la taille et permet de déterminer la longueur à laquelle 50% des individus ont atteint la maturité sexuelle (LM50). Pour les espèces ne bénéficiant pas de données de maturité, un travail bibliographique a été réalisé afin de déterminer la taille seuil. La taille à maturité sexuelle mise en évidence a servi à identifier la proportion des juvéniles présents dans chaque trait sur la base des spectres de taille disponibles. Cette proportion a été rapportée à la densité totale pour obtenir la densité des juvéniles et des adultes dans chaque trait de chalut par an. Un travail bibliographique a été effectué pour distinguer les adultes reproducteurs (servant de proxi des zones de frayères), les adultes non reproducteurs (en phase de croissance) pour les espèces de poissons avec les juvéniles représentant les zones de nourriceries.

La taille à maturité sexuelle de chaque espèce, la différenciation entre adultes reproducteurs et non reproducteurs chez les poissons, et les sources, sont indiqués ci-dessous:

Chelidonichthys cuculus : 18.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992; voir "Source 1")

Boops boops : 13.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Eledone moschata : 9.0 cm (Krstulović-Šifner & Vrgoc, 2009 et Campillo, 1992)

Illex coindetii : 14.9 cm (Données MEDITS; Campillo, 1992)

Micromesistius poutassou : 18.9 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Serrat et al., 2019; Mir-Arguimbau et al., 2020)

Nephrops norvegicus : 3.4 cm (Données MEDITS; voir "Source 2")

Pagellus acarne : 19.9 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Velasco et al., 2011 et Campillo, 1992)

Pagellus bogaraveo : 30.0 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Mytilineou et al., 2013; Campillo, 1992)

Pagellus erythrinus : 16.5 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Busalacchi et al., 2014; Campillo, 1992)

Parapenaeus longirostris : 4.0 cm (Données MEDITS; Arculeo et al., 2014)

Phycis blennoides : 19.5 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Rotllant et al., 2002)

Scomber scombrus : 20.7 cm, Juvénile/Adulte non reproducteur (Campillo, 1992)

Trachurus mediterraneus : 23.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Zeus faber : 40.0 cm, Juvénile/Adulte reproducteur (Campillo, 1992)

Concernant la distribution des espèces, les données ont d'abord été transformées par logarithme décimal log10(x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été réalisés par stade de vie pour créer les cartes de densité interpolée. Un variogramme empirique permet d'observer la relation spatiale des points d'échantillonnage : il va calculer l’autocorrélation entre chaque paire de points dans des classes de distances croissantes et identifier si les points ont une organisation particulière dans l’espace. Le variogramme, basé sur les données multi-annuelles (moyenne des densités par station), a été ajusté par une des fonctions continues autorisées dans le cadre de la géostatistique : effet pépitique, exponentiel, circulaire, sphérique, puissance ou gaussien, choisie sur la base du meilleur ajustement statistique. Les géostatistiques ne peuvent être en principe appliquées que si les données ont un comportement isotropique (varient de la même façon dans toutes les directions). De façon à vérifier cette condition, un variogramme directionnel dans quatre directions (0°, 45°, 90°, 135°) a également été produit pour détecter une possible anisotropie des données, ce qui n’a pas été le cas. Enfin, de façon à vérifier qu’aucune tendance longue portée ne vienne perturber significativement l’estimation krigée, une cross-validation a été réalisée a posteriori pour vérifier l’utilité de sa prise en compte, ce qui a été rejeté dans tous les cas. Un krigeage utilisant les paramètres du variogramme ajusté précédemment et avec une résolution de 0.1° va estimer, en utilisant les valeurs multi-annuelles, les valeurs de densité aux emplacements non échantillonnés ainsi que l’estimation de la variance (ou erreur) de krigeage permettant d’avoir une mesure de l’incertitude liée à l’estimation. L’erreur de krigeage correspond ici à l’écart-type (racine carré) de la variance de krigeage. Une rastérisation avec une résolution de 0.05° et une distance maximum d’extrapolation de 0.2° est ensuite effectuée pour obtenir la carte de densité pluriannuelle interpolée par espèce.

Description
Occurrence moyenne supérieure ou égale à 20%
Rationale
Sélection des espèces pour une cartographie pluriannnuelle (distribution moyenne sur l’ensemble de la période)
Description
Surface = distance (km) / ouverture filet (km)
Rationale
Calcul de la surface balayée par trait de chalut
Description
Densité totale = nombre individus / surface (km²)
Rationale
Calcul de la densité totale par espèce, par station, par année
Description
Recherche bibliographique ou régression logistique
Rationale
Identification de la taille à maturité sexuelle (LM50) pour différencier les juvéniles des adultes
Description
Recherche bibliographique sur la période de reproduction des poissons
Rationale
Identification des adultes reproducteurs et des adultes non reproducteurs
Description
Log10(x+1)
Rationale
Normalisation des données
Description
Construction et modélisation du variogramme
Rationale
Exploration des données - Autocorrélation spatiale entre chaque paire de points
Description
Krigeage ordinaire
Rationale
Interpolation des données réelles dans la zone d'étude
Description
Rastérisation
Rationale
Deuxième interpolation avec une résoluation à 0.05°
File identifier
6ee09862-534b-4f49-ae75-8ab167b93f07 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-05-15T22:48:46.796669Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Author
  IFREMER - De Rock Pauline
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sète , France
Point of contact
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Point of contact
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
 
 

Overviews

overview

Spatial extent

N
S
E
W
thumbnail


Keywords

Eolien - Groupe
Ichtyofaune
Eolien - Jeu de données
Medits
Eolien - Stade
Adulte Juvénile
Eolien - Type
Densité Variance de krigeage
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Répartition des espèces
SIH - Espèces scientifiques
Pagellus acarne
Thèmes Sextant
/Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique

Provided by

logo
Access to the portal
Read here the full details and access to the data.

Associated resources

Not available


  •  
  •  
  •