GAMMA

Expérimentation de l'effet sur la réponse transcriptomique au stress et à l'acclimatation chez deux populations d'hupitre perlière (P. margaritifera).

Date (Creation): 2018-11-08

Identifier: FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_GAMMA

Credit: Ifremer - Unité Ressources Marines en Polynésie

Author

IFREMER - Jeremy Le Luyer

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0

Habitats et biotopes

Thèmes Sextant

/Milieu biologique/Bio-Informatique

ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names

Bioinformatique

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Hierarchy level: Dataset

Statement: Une eau usée a été utilisée pour contaminer 3 bacs d’eau de mer dans lesquels trois lots d'huîtres (deux lots d'huitres creuses et un lot d’huitre plate) ont été immergés pendant 24 heures. L'extraction et la purification des particules virales à partir de l'eau usée et des huitres, ont été réalisé sous forme de triplicats. La synthèse des cDNA ont été faites en utilisant deux types d'hexamers (random, et LSEM), et pour deux librairies avec ceux publiés par Endoh. La construction des librairies a été réalisée avec un kit ciblant les ARNs viraux (Vircap-Vert, Roche).