Le référentiel des espèces scientifiques se base sur le World Reference Marine Species (WoRMS) et sur Fishbase pour les poissons. Le WoRMS est le référentiel taxinomique reconnu par la communauté scientifique internationale et préconisé pour les rapportages au CIEM.

Comme dans le WoRMS, le référentiel Harmonie est hiérarchique et suit l’arbre taxinomique (espèce, genre, famille, ordre, …). En plus du nom scientifique et du niveau systématique de l’espèce, l’autorité et l’AphiaID (identifiant unique du WoRMS) sont bancarisés dans Harmonie. Étant donné les évolutions rapides de la taxinomie, la notion de taxons référents ou synonymes est gérée.

Pour les individus mesurés dans les différentes actions de collecte, les espèces scientifiques sont liées au référentiel des relations taille-poids. Ces dernières permettent lors de la saisie de contrôler la cohérence entre les mesures de taille et de poids pour un individu ou un échantillon, ou d’estimer un des 2 paramètres s’il n’a pu être observé.

Les ajouts et modifications sont faits au fur et à mesure en fonction des demandes des utilisateurs. Les mises à jour sont validées par des experts de la thématique avant d’être réalisées en base.

The scientific species reference is based on the World Reference Marine Species (WoRMS) and on Fishbase for fish. WoRMS is the taxonomic reference system recognised by the international scientific community and recommended for ICES reporting.

As in WoRMS, the Harmonie repository is hierarchical and follows the taxonomic tree (species, genus, family, order, etc.). In addition to the scientific name and the systematic level of the species, the authority and the AphiaID (unique identifier of WoRMS) are stored in Harmonie. Given the rapid evolution of taxonomy, the notion of referent or synonymous taxa is managed.

For individuals measured in the various collection actions, the scientific species are linked to the size-weight relationship reference system. These allow the consistency between height and weight measurements for an individual or a sample to be checked during data entry, or to estimate one of the two parameters if it could not be observed.

Additions and modifications are made as and when requested by users. Updates are validated by experts in the field before being implemented in the database.