Expertise en matiere de performances biologiques et zootechniques, notamment en cas d'anomalies biologiques. Plus generalement, elle constituera un élément d'évaluation de l'état de santé des écosystèmes et pourra aider à orienter les stratégies de production.

Producteurs de données : Ifremer

Durée du réseau : réseau pérenne

Convention DPMA 2014-IFREMER n°13 /1210868 / NYF Projet PJ0701 Observations, analyse et prévision des performances conchylicoles.

Maître d'ouvrage :

Direction générale de l’alimentation (DGAL)

Maître d'œuvre :

IFREMER

Financeur(s) :

DGAl

L'année 2015 est une année de transition initiant l’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins mise en œuvre par l’Ifremer. Le dispositif de surveillance constitué de 4 axes répond à deux objectifs.

Trois axes sont mis en place pour répondre au premier objectif .

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2.

La surveillance planifiée des mortalités et des maladies de la moule bleue Mytilus edulis s’appuyant sur le réseau MYTILOBS 2. Ces deux réseaux se basent sur un suivi régulier d’indicateurs de santé chez les animaux sur des sites ateliers.

La surveillance événementielle des mortalités des autres espèces de mollusques marins (moule Mytilus galloprovincialis comprise) s’appuyant sur le réseau REPAMO 2.Ce réseau, se base sur la déclaration de mortalités des conchyliculteurs ou des pêcheurs professionnels aux services déconcentrés de l’Etat, les Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM).Un axe est mis en place pour répondre au deuxième objectif. La surveillance planifiée, ciblée et fondée sur le risque d’introduction et d’installation de Microcytos mackini chez l’huître creuse Crassostrea gigas s’appuyant sur le réseau RESCO 2. Cette surveillance se base sur un suivi régulier du site atelier de Loix-en-Ré. La surveillance s'applique à des populations de coquillages d'intérêt commercial que ce soient des populations d'élevage ou des populations sauvages du littoral français.

L'unité épidémiologique peut être une concession ou un parc ostréicole, une écloserie - nurserie, un gisement naturel, une zone ou une partie de zone. Toutes les unités épidémiologiques peuvent faire l'objet d'un échantillonnage en fonction du protocole d’épidémiosurveillance considéré.Les données collectées dans le cadre du réseau REPAMO 2 sont de deux types : des informations concernant le prélèvement (commémoratifs) et des résultats d'analyses. Pour chaque protocole d’épidémiosurveillance, les commémoratifs sont collectés de manière systématique par des correspondants de terrain Ifremer en s’appuyant sur des questionnaires élaborés sous démarche qualité. Les animaux prélevés sont analysés par la cellule analytique du Laboratoire de pathologie et de génétique Ifremer de La Tremblade. La méthode analytique de référence préconisée pour la détection des organismes pathogènes des maladies réglementées est l’histo-pathologie. L'effectif analysé permet de compenser la faible sensibilité et spécificité de cet outil, notamment sur des agents infectieux autres que parasitaires. D'autres outils de diagnostic sont utilisés en complément, principalement des techniques de biologie moléculaire telles que la PCR mais également la culture (bactérienne par étalement – isolement de souches majoritaires, parasitaire en milieu thioglycollate), l'hybridation in situ, la microscopie électronique à transmission, la caractérisation d’espèces par séquençage.

2015 was a year of transition initiating changes in how Ifremer monitors the health of marine molluscs. The monitoring process consists of 4 strands and serves 2 objectives.

Three strands have been put in place to meet the first objective.

Planned monitoring of mortalities and diseases of the Crassostrea gigas oyster using the RESCO 2 network.

Planned monitoring of blue mold Mytilus edulis mortalities and diseases using the MYTILOBS 2 network. These two networks focus on regular monitoring of animal health indicators at the sites.

Events monitoring of mortalities of other species of marine molluscs (the Mytilus galloprovincialis mussel included) uses the REPAMO network 2. This network makes use of the data on mortalities reported by shellfish farmers or by professional fishermen to the decentralized services of the State, the Departmental Directorate of Territories and Sea.

One strand has been put in place to meet the second objective. The planned, targeted and risk-based monitoring of the introduction and establishment of Microcytos mackini in the Crassostrea gigas cupped oyster depends on the RESCO 2 network. This monitoring is based on regular follow-up of the Loix-en-Ré site. The surveillance applies to shellfish populations of commercial interest on the French coast whether they are farmed or wild.

The epidemiological unit may be a concession or an oyster farm, a hatchery-nursery, a natural bed, an area or part of an area. All epidemiological units can be sampled according to the given epidemiological surveillance protocol. Two types of data are collected in the REPAMO 2 network: information on the collection (commemorative) and results from analyses. For each epidemiosurveillance protocol, memorials are systematically collected by Ifremer field correspondents based on questionnaires developed as part of a quality approach. The animals collected are analyzed by the analytical section of Ifremer’s Pathology and Genetics Laboratory in La Tremblade. The analytical reference method recommended for the detection of pathogenic organisms of regulated diseases is histopathology. The number of samples analyzed makes it possible to compensate for the low sensitivity and specificity of this tool, especially for infectious agents other than parasites. Other diagnostic tools are used in addition. These mostly include molecular biology techniques such as PCR but also cultures (bacterial spread - isolation of majority strains, parasitic in thioglycolate medium), in situ hybridization, transmission electron microscopy, characterization of species by sequencing.

Nombre de points d'observation ou de mesure : 13

Type de données :

La biometrie est realisee individuellement sur 30 moules, sauf pour le poids total. Les mesures sont effectuees apres le nettoyage des coquillages.

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

- Mesures (longueur, largeur, Le gain de longueur saisonnier) ;

- Poids total ;

- Poids sec (poids sec de chair, poids sec de coquille) ;

- Indices de condition ;

- Mortalité.

Fréquence d'observation : Trimestrielle