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16S sanger sequencing data for caracterisation of bacteria strains for MOSARDEF 2022 project

Séquences partielles de l'ADNr 16s de souches bactériennes de référence ou collectées sur des huîtres. Acquises par séquençage Sanger.

Simple

Date (Creation)
2020-03-06
Date (Publication)
2022-10-14
Identifier
FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_SEQ_SANGER_OYSTERS_MOSARDEF

Identifier

No information provided.
Credit
Ifremer - IHPE
Publisher
  IFREMER
Author
  IFREMER - De San Nicolas Noemie
Author
  IFREMER - Destoumieux-Garzon Delphine
Author
  IFREMER - Montagnani Caroline
Université de Montpellier - Campus Triolet - Place E. Bataillon - CC080 - 34095 Montpellier Cedex 5 , Montpellier , France
04 67 14 46 25
Author
  IFREMER - Travers Marie-Agnes
Université de Montpellier - Campus Triolet - Place E. Bataillon - CC080 - 34095 Montpellier Cedex 5 , Montpellier , France
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Habitats et biotopes
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Bio-Informatique
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
  • Bioinformatique
Type de jeux de donnée ODATIS
  • Données d'analyse
 
Use limitation
CC0 (Creative Commons - Transfer into public domain)
Access constraints
License
Use constraints
License
Spatial representation type
grid Grid
Metadata language
English
Character set
utf8 UTF8
N
S
E
W
thumbnail


Vertical extent

Reference system identifier
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6

Spatial representation info

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Distribution format
  • ( )

OnLine resource
/home/ref-bioinfo-public/ifremer/ihpe/MOSARDEF/data/raw-sequence/sanger ( NETWORK:LINK )
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Publication ( WWW:LINK-1.0-http--publication-URL )

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Digital Object Identifier (DOI) ( DOI )
Hierarchy level
Dataset
Statement

41 souches bactériennes de référence (ATCC, CIP ou autre) ou collectées sur des huîtres par le laboratoire IHPE de l’Ifremer, Montpellier.

Les séquences ont été obtenues par séquençage Sanger de l'ADNr 16s complet (SA dir-S17rev) ou partiel (V3-V4)

File identifier
0d529567-92fd-4dcd-9d9c-70e98ab6f772 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Non geographic dataset
Date stamp
2025-12-13T10:10:58.214417Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  IFREMER - Travers Marie-Agnes
Université de Montpellier - Campus Triolet - Place E. Bataillon - CC080 - 34095 Montpellier Cedex 5 , Montpellier , France
Point of contact
  IFREMER - De San Nicolas Noémie
 
 

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Keywords

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Habitats et biotopes
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
Bioinformatique
Thèmes Sextant
/Milieu biologique/Bio-Informatique
Type de jeux de donnée ODATIS
Données d'analyse

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