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Biomasse annuelle de l'espèce Lytocarpia myriophyllum dans le Golfe du Lion (MEDITS, 2012-2019)

La biomasse (poids/km²) a été calculée annuellement à partir des données de la campagne MEDITS entre 2012 et 2019. Les données ont été transformées par logarithme décimal log10 (x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été effectués pour interpoler les données dans le Golfe du Lion. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.

Simple

Date (Creation)
2020-08-07
Identifier
DOI:10.12770/4b183f92-eb31-43a8-aca1-0705fb45de5b
Credit
Ifremer - Eolien flottant A06
Point of contact
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Point of contact
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
Author
  IFREMER - De Rock Pauline
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sète , France
Author
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Author
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
Publisher
  Ifremer
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Répartition des espèces
Sous-regions marines
  • /Métropole/Méditerranée occidentale
Eolien - Jeu de données
  • Medits
Eolien - Type
  • Biomasse
SIH - Espèces scientifiques
  • Lytocarpia myriophyllum
Eolien - Groupe
  • Invertébré benthique
Use limitation
CC-BY-NC-SA (Creative Commons - Attribution, Pas d’utilisation commerciale, Partage dans les mêmes conditions)
Access constraints
Copyright
Use constraints
Copyright
Spatial representation type
grid Grid
Distance
0.05  meter
Metadata language
Français
Character set
utf8 UTF8
Topic category
  • Oceans
N
S
E
W
thumbnail


Begin date
2012-01-01
End date
2019-12-31
Unique resource identifier
EPSG:4326
Number of dimensions
1
Dimension name
Vertical
Dimension size
1640
Cell geometry
Area
Transformation parameter availability
No
Distribution format
  • ( )

OnLine resource
DOI du jeu de données ( DOI )

DOI du jeu de données

OnLine resource
Biomasse_annuelle_LYTOMYR ( WWW:DOWNLOAD )

Biomasse annuelle

OnLine resource
Biomasse_annuelle_LYTOMYR_2012_2019 ( OGC:WMS )

Biomasse annuelle

Hierarchy level
Dataset

Domain consistency

Conformance result

Date (Publication)
2010-12-08
Explanation
See the referenced specification
Statement

La campagne MEDITS est une campagne de chalutage de fond standardisée et coordonnée à l'échelle internationale ciblant les ressources démersales et benthiques en mer Méditerranée et qui se déroule tous les ans au printemps depuis 1994. Chaque année, 65 stations fixes sont échantillonnées en moyenne dans le Golfe du Lion. L’identification de chaque individu capturé dans les traits de chalut est réalisée au niveau spécifique puis les poids et le nombre d'individus par espèce sont déterminés. La taille, le sexe et la maturité sont récoltés quand cela est prévu en fonction du protocole défini pour chaque espèce.

Les espèces correctement échantillonnées et suffisamment abondantes, c'est à dire possédant une occurrence minimum supérieure ou égale à 20% entre 1994 et 2019, ont bénéficié d'une cartographie annuelle sur cette période.

Une préparation des données a été préalablement effectuée avant la création des cartes de distribution. Le calcul de la surface balayée par trait de chalut a été effectué afin de calculer la biomasse totale (poids/km²) par station, par année et par espèce. Les moyennes des latitudes et longitudes ont été calculées par trait de chalut. De façon à travailler dans un système orthonormé, la longitude a été transformée (Lon*cos(Lat*pi/180)). La différenciation entre les juvéniles et les adultes pour chaque espèce n'a pas été réalisée à cause du manque de données de taille.

Concernant la distribution des invertébrés benthiques, les données de 2012 à 2019 ont d'abord été transformées par logarithme décimal log10(x+1) puis une analyse variographique et un krigeage ordinaire ont été réalisés pour créer les cartes de biomasse interpolée. Un variogramme empirique permet d'observer la relation spatiale des points d'échantillonnage : il va calculer l’autocorrélation entre chaque paire de points dans des classes de distances croissantes et identifier si les points ont une organisation particulière dans l’espace. Le variogramme, basé sur les données multi-annuelles (moyenne des biomasses par station), a été ajusté par une des fonctions continues autorisées dans le cadre de la géostatistique : effet pépitique, exponentiel, circulaire, sphérique, puissance ou gaussien, choisie sur la base du meilleur ajustement statistique. Les géostatistiques ne peuvent être en principe appliquées que si les données ont un comportement isotropique (varient de la même façon dans toutes les directions). De façon à vérifier cette condition, un variogramme directionnel dans quatre directions (0°, 45°, 90°, 135°) a également été produit pour détecter une possible anisotropie des données, ce qui n’a pas été le cas. Enfin, de façon à vérifier qu’aucune tendance longue portée ne vienne perturber significativement l’estimation krigée, une cross-validation a été réalisée a posteriori pour vérifier l’utilité de sa prise en compte, ce qui a été rejeté dans tous les cas. Un krigeage utilisant les paramètres du variogramme ajusté précédemment et avec une résolution de 0.1° va estimer les valeurs de biomasse annuelles aux emplacements non échantillonnés ainsi que l’estimation de la variance (ou erreur) de krigeage permettant d’avoir une mesure de l’incertitude liée à l’estimation. L’erreur de krigeage correspond ici à l’écart-type (racine carré) de la variance de krigeage. Une rastérisation avec une résolution de 0.05° et une distance maximum d’extrapolation de 0.2° est ensuite effectuée pour obtenir les cartes de biomasse interpolée annuelles par espèce. Une carte de variance de krigeage a été calculée pour chaque espèce et chaque pas de temps.

Description
Occurrence minimum supérieure ou égale à 20%
Rationale
Sélection des espèces suffisamment échantillonnées pour une cartographie annnuelle
Description
Surface = distance (km) / ouverture filet (km)
Rationale
Calcul de la surface parcourue par trait de chalut
Description
Biomasse totale = poids / surface (km²)
Rationale
Calcul de la biomasse totale par espèce, par station, par année
Description
Log10(x+1)
Rationale
Normalisation des données
Description
Construction et modélisation d'un variogramme
Rationale
Exploration des données - Autocorrélation spatiale entre chaque paire de points
Description
Krigeage ordinaire
Rationale
Interpolation des données réelles dans la zone d'étude
Description
Rastérisation
Rationale
Deuxième interpolation avec une résoluation à 0.05
File identifier
4b183f92-eb31-43a8-aca1-0705fb45de5b XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-05-15T22:16:36.206895Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Author
  IFREMER - De Rock Pauline
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sète , France
Point of contact
  IFREMER - Vaz Sandrine
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
Point of contact
  IFREMER - Hattab Tarek
Station de Sète - Avenue Jean Monnet - CS 30171 - 34203 Sète Cedex , Sete , France
04 99 57 32 35
 
 

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N
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Keywords

Eolien - Groupe
Invertébré benthique
Eolien - Jeu de données
Medits
Eolien - Type
Biomasse
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Répartition des espèces
SIH - Espèces scientifiques
Lytocarpia myriophyllum
Thèmes Sextant
/Milieu biologique/Espèces/Espèces d'intérêt halieutique

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