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Whole digestive gland transcriptome of the cupped oyster Crassostrea gigas in response to different strains of the dinoflagellates Alexandrium

We explored the whole digestive gland transcriptome in the Pacific oyster Crassostrea gigas using Illumina sequencing technology and compare the expression patterns obtained in: i) oysters exposed experimentally at environmentally-realistic concentration to Alexandrium minutum Daoulas1257 strain isolated from the Bay of Brest in France producing only PSTs; ii) AM89BM strain, isolated from the Bay of Morlaix in France producing both PSTs and BECs; iii) CCMI1002 strain, isolated from Irish waters producing only BECs; and iv) control oysters fed with the non-toxic dinoflagellate Heterocapsa triquetra.

Simple

Date (Creation)
2015-03-01
Date (Publication)
2017-10-18
Identifier
FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_TOXICITE_ALEXANDRIUM_MINUTUM_CRASSOSTREA_GIGAS
Credit
Ifremer - Laboratoire Physiologie des Invertébrés, ANR ACCUTOX
Point of contact
  IFREMER - Huvet Arnaud
Centre Bretagne - ZI de la Pointe du Diable - CS 10070 - 29280 Plouzané , Brest , France
02 98 22 46 93
02 98 22 46 53
Author
  UBO - Fabioux Caroline
Author
  Vienna Biocenter - Mat Audrey
Author
  CNRS - Hegaret Helene
Author
  INRAE - Klopp Christophe
Author
  CNRS - Soudant Philippe
Author
  IFREMER - Huvet Arnaud
Centre Bretagne - ZI de la Pointe du Diable - CS 10070 - 29280 Plouzané , Brest , France
02 98 22 46 93
02 98 22 46 53
Publisher
  IFREMER
IFREMER Centre de Bretagne ZI Pointe du diable CS 10070 , PLOUZANE , 29280 , France
+33 (0)2 98.22.49.16
+33 (0)2 98.22.46.44
http://data.ifremer.fr/SISMER
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Habitats et biotopes
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Bio-Informatique
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
  • Bioinformatique
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Use constraints
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Metadata language
English
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utf8 UTF8
Topic category
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Reference system identifier
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
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  • ( )

OnLine resource
/home/ref-bioinfo-public/ifremer/pfom/AmiTox ( NETWORK:LINK )
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Digital Object Identifier (DOI) ( DOI )
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Dataset
Statement

Les efflorescences de microalgues productrices de toxines ont des impacts socio-économiques et écologiques majeurs. En France, des efflorescences de microalgues toxiques du genre Alexandrium peuvent entraîner la contamination des coquillages et s’avérer toxiques pour les consommateurs. Ces microalgues produisent différents types de toxines, des toxines paralysantes (PST) d'une part

et des composés allélopathiques d'autre part. Le présent travail initie des études sur les perturbations moléculaires spécifiques et synergiques des toxines et composés allélopathiques.

File identifier
2a2852a9-7179-4660-949e-c8d8226f13db XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-05-15T21:48:06.989872Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  IFREMER - Huvet Arnaud
Centre Bretagne - ZI de la Pointe du Diable - CS 10070 - 29280 Plouzané , Brest , France
02 98 22 46 93
02 98 22 46 53
 
 

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GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Habitats et biotopes
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
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