En complément du dispositif COREPH plateau, le COREPH plateau et profond vient davantage décrire le milieu pélagique profond (méso- et bathypélagique). En effet, il s’intéresse au micronecton océanique (i.e. crustacés, poissons et céphalopodes de taille relativement petite, comprise généralement entre deux et une vingtaine de centimètres) prélevé au niveau des canyons du talus continental. Ce micronecton joue en effet un rôle central à la fois dans le fonctionnement du réseau trophique en assurant le transfert d'énergie du plancton vers les prédateurs supérieurs, mais aussi dans certains cycles biogéochimiques de ces écosystèmes pélagiques profonds en tant que composante de la « pompe biologique ». Cependant, le micronecton océanique et plus généralement les écosystèmes profonds ont fait l'objet de très peu d’études en France jusqu’à présent. Un effort notable devait donc être réalisé pour suivre et évaluer l’état écologique de ce réservoir essentiel pour la biodiversité marine. En 2017 et 2018, un suivi mutualisé D1, D4, D8 sur ces communautés a été mené à travers une série de chalutages conduite sur les campagnes halieutiques EVHOE dans le golfe de Gascogne. Les premiers résultats de cette étude ont ainsi confirmé la riche biodiversité et la complexité du réseau trophique en zone méso à bathypélagique. Mais, les conclusions les plus marquantes ont été liées à la mise en évidence d’une contamination chimique des écosystèmes pélagiques profonds du golfe de Gascogne, notamment par des POP historiques et émergents, mais aussi par certains métaux potentiellement toxiques mesurées chez quinze espèces représentatives de la communauté étudiée. Les données obtenues ont permis de définir un état de référence de la contamination actuelle de ces populations dans le golfe de Gascogne et ont confirmé le potentiel de suivi à long terme de ces communautés pour renseigner des indicateurs du Bon Etat Ecologique. La pérennisation de ce suivi permettra d’assurer une cohérence scientifique et opérationnelle au dispositif COREPH déployé sur le plateau continental, en constituant un continuum unique pour le suivi de la biodiversité et de sa contamination des eaux côtières aux couches profondes de l’Océan.