Les habitats benthiques constituent une composante du Descripteur 1 - Biodiversité de la DCSMM : « La diversité biologique est conservée. La qualité des habitats et leur nombre, ainsi que la distribution et l’abondance des espèces sont adaptées aux conditions physiographiques, géographiques et climatiques existantes » (Directive 2008/56/UE).

Dans sa version révisée, la Décision 2017/848/UE relative aux normes méthodologiques pour l’atteinte du Bon État Écologique (BEE) de la composante de biodiversité « Habitat benthiques » repose sur deux critères primaires :

- Critère primaire D6C4 : « L'étendue de la perte du type d'habitat résultant de pressions anthropiques ne dépasse pas une proportion donnée de l'étendue naturelle du type d'habitat dans la zone d'évaluation » ;

- Critère primaire D6C5 : « L'étendue des effets néfastes liés aux pression anthropiques sur l'état du type d'habitat, notamment l'altération de sa structure biotique et abiotique et de ses fonctions (par exemple, composition en espèces caractéristiques et abondance relative de celles-ci, absence d'espèces particulièrement sensibles ou fragiles ou d'espèces assurant une fonction clé, structure par taille des espèces), ne dépasse pas une proportion donnée de l'étendue naturelle du type d'habitat dans la zone d'évaluation ».

Les grands types d’habitats benthiques sont les éléments constitutifs des critères D6C4 et D6C5. La Décision 2017/848/UE précise que d’autres types d’habitats peuvent également être considérés comme éléments constitutifs (cf. précisions dans le dernier paragraphe de la section 1.1). Le tableau 2 de l’annexe de la Décision révisée 2017/848/UE (Critères et normes méthodologiques d'évaluation de l'atteinte du bon état écologique) précise les 22 grands types d’habitats benthiques (Tableau I.1.1). Leur typologie (suivant le référentiel EUNIS v2019) au titre du Descripteur 1 est définie à un niveau EUNIS 2, correspondant à la combinaison de la nature du fond marin (roches et récifs biogènes, vases, sables, sédiments grossiers, sédiments hétérogènes) et leur gradient d’éloignement à la côte (du médiolittoral au bathyal). Selon la sous-région marine (SRM) considérée, entre 17 [SRM Manche-Mer du Nord (MMN)] et 22 grands types d’habitats [SRM Mers Celtiques (MC), Golfe de Gascogne (GdG), Méditerranée Occidentale (MO)] sont représentés dans les eaux marines de métropole française.