Catalogue PIGMA
DCSMM2018 - HP - D1C6 - Ratio de la concentration de surface en chlorophylle a contenue dans les dinoflagellés sur celle contenue dans les diatomées (2012-2016)
Le critère de définition du bon état écologique pour le descripteur D1 – Habitats pélagiques est le critère D1C6 : « les caractéristiques du type d'habitat, notamment sa structure biotique et abiotique et ses fonctions, ne subissent pas d'effets néfastes dus à des pressions anthropiques ». Un des indicateurs retenus, développés pour les communautés phyto- et zooplanctoniques, est l’indicateur PH1, basé sur la dynamique comparée de groupes fonctionnels (ou paires de formes de vie). Les échelles d’évaluation géographiques considérées sont les masses d’eau côtières de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE) à la côte et les paysages marins mensuels au large, combinés sur une seule couche annuelle pour les besoins de l’évaluation. Le PH1 est en cours de développement et d’adaptation aux données disponibles dans les SRM, la période de référence et les seuils restent à définir pour cet indicateur. L’évaluation du bon état écologique n’a donc pu être effectué pour ce premier cycle DCSMM.
Les données sont présentées sous la forme de fichiers géoréférencés de type shapefile.
Simple
- Date (Creation)
- 2018
- Identifier
- DCSMM2018_CNRS_HP_D1C6_CHLOROPHYLLE_A_RATIO
- Identifier
- DOI:10.12770/921f5fbb-4fca-49e7-ba1c-8ef2a9dbdcdd
- Credit
- CNRS
+33 (0)2 98.22.46.44
http://www.ifremer.fr/sismer/
- Thèmes Sextant
-
- /Milieu chimique/Colonne d'eau
- GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
-
- Répartition des espèces
- Theme
-
- évaluation
- bon état écologique
- chlorophylle
- habitat pélagique
- Données ouvertes
- DCSMM : Descripteurs
-
- D1: Biodiversité - Habitats pélagiques
- Sous-regions marines
-
- /Métropole/Golfe de Gascogne
- /Métropole/Manche mer du Nord
- Cadre Réglementaire - SIMM
-
- Directive Cadre pour la Planification de l'Espace Maritime (DCPEM)
- Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM)
- Thématiques - SIMM
-
- /Etat du Milieu/Biogéochimie
- Use limitation
- Données sous Licence Creative Commons - Attribution (BY) : http://creativecommons.fr/licences/
- Access constraints
- License
- Use constraints
- Copyright
- Spatial representation type
- vector Vector
- Denominator
- 100000
- Metadata language
- Français
- Character set
- utf8 UTF8
- Topic category
-
- Biota
))
- Begin date
- 2012
- End date
- 2016
- Reference system identifier
- EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
- Geometric object type
- Surface
- Distribution format
-
-
(
)
-
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- OnLine resource
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique
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- Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Mer Celtique
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DOI du jeu de données
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DOI du jeu de données
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Manche Mer du Nord
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Janv-Mars) en Golfe de Gascogne
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- Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Juillet-Septembre) en Golfe de Gascogne
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique
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- Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Mer Celtique
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- Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Manche Mer du Nord
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne
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Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne
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- Description
- Rapport Dinoflagellés/Diatomées (Octobre-Décembre) en Golfe de Gascogne
- Hierarchy level
- Dataset
Domain consistency
Conformance result
- Date (Publication)
- 2010-12-08
- Explanation
- See the referenced specification
- Statement
-
Les indicateurs pour l’évaluation du bon état écologique des habitats pélagiques, ont été développés dans le cadre de la convention OSPAR par le groupe de travail « Intersessional Correspondence Group - Coordination of Biodiversity Assessment and Monitoring » (ICG-COBAM.
L’indicateur PH1 est basé sur la méthode du Plankton Index (PI, Gowen et al., 2013 ; Tett et al., 2013). En raison du manque de données complètes par paire de groupes fonctionnels et de la difficulté d’accessibilité de son script, le PH1 n’a pu être évalué pour l’évaluation 2018. En complément, une approche parallèle au PH1 (ratios à partir de données pigmentaires extraites à partir de la modélisation) a pu être proposée, pour une des paires de groupes fonctionnels, de façon à couvrir les différentes SRM. Cette approche n’est pas destinée à être généralisée à l’avenir, ni à remplacer le PH1. Elle est présentée à titre d’exemple, afin d’illustrer le potentiel de ce type de données pour renseigner un des couples fonctionnels (dinoflagellés/diatomées) qui permettront de calculer le PH1.
Le calcul de ce rapport dinoflagellés/diatomées s’est fait via la concentration en chlorophylle a. à partir des données issues de la modélisation par le modèle ECO-MARS3D ; par trimestre pour rendre compte de la phénologie des groupes d'espèces considérés. La métrique choisie est le percentile 90 de la concentration en chlorophylle a de chacun de ces groupes. Ce processus s’est fait au moyen de scripts informatiques écrits en langage R (https://cran.r-project.org/), il se passe en plusieurs étapes (Figure 4) :
1-Traitement des données de campagnes mesurées in situ pour obtenir des matrices géoréférencées.
2-Compilation de toutes les matrices (sous forme de raster NetCDF) comprises dans chaque trimestre pour la période d'évaluation (2012-2016).
3-Extraction des données (dinoflagellés et diatomées) de surface contenues dans chacune des UGE.
4-Calcul du percentile 90 par trimestre dans chacune de ces UGE pour synthétiser l’information à une échelle plus propice à l’interprétation et compatible avec le calcul des indicateurs.
5-Calcul du rapport dinoflagellés / diatomées par UGE
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