Catalogue PIGMA
Suivi de la diversité bactérienne sur les vasières intertidales
Les vasières intertidales sont un système clé du réseau étroitement connecté d’écosystèmes qui forment la transition entre le bassin versant et le domaine océanique. Leur forte productivité est liée à l’activité d’un biofilm de diatomées, dont le fonctionnement et le devenir ont récemment fait l’objet de plusieurs programmes de recherche. En revanche, le déterminisme et le devenir de la production bactérienne associée à la sécrétion d’ExoPolySaccharides dans ce biofilm est peu connu.
Les premières études montrent pourtant que cette production est au moins équivalent à celle des diatomées. Une vision intégrée du fonctionnement écologique des vasières intertidales dans un schéma plus global des flux de carbone demande donc impérativement de décrire et quantifier le déterminisme de cette production bactérienne et son devenir dans l’écosystème.
Simple
- Date (Creation)
- 2006-01-01T00:00:00
- Identifier
- FR-DCSMM-PDS-VASIREMI
- Presentation form
- Digital profile
- Credit
- Producteurs de données : UMR LIENSS 7276
- Status
- onGoing On going
- Maintenance and update frequency
- Unknown
- Maintenance note
- Durée du réseau : réseau temporaire
- Theme
-
- Diversité
- Abondance
- Bactéries
- Vasières
- Intertidal
- GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
-
- Habitats et biotopes
- Sous-regions marines
-
- /Métropole/Golfe de Gascogne
- DCSMM : Type d'espace concerné
-
- Pas d'espace particulier concerné
- DCSMM : Descripteurs
-
- D4: Réseaux trophiques
- D1: Biodiversité
- DCSMM : Méthodes de recueil des données
-
- Observation par point
- Thèmes Sextant
-
- /Milieu biologique/Habitats
- Access constraints
- Other restrictions
- Other constraints
- Accès confidentiel
- Spatial representation type
- vector Vector
- Denominator
- 50000
- Metadata language
- Français
- Character set
- utf8 UTF8
- Topic category
-
- Oceans
))
- Supplemental Information
-
Maître d'ouvrage :
UMR LIENSS 7276 2007-2013
Maîtres d'œuvre :
UMR LIENSS 7276 2007-2013
Financeur(s) :
ANR 2007-2011
CPER 2011-2013
- Reference system identifier
- EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 7.9
- Topology level
- Geometry only
- Geometric object type
- Complex
- Geometric object count
- 0
- Hierarchy level
- Dataset
Absolute external positional accuracy
Conformance result
- Date (Creation)
- 2012-01-16
- Explanation
- Non évalué
- Pass
- No
- Statement
-
Dans le sédiment :
- Diversité bactérienne obtenue par pyroséquençage (sous-traité).
- Abondance totale des procaryotes mesurée par cytométrie en flux (méthode en cours de développement).
- Quantification de la capacité dénitrifiante bactérienne obtenue par PCR quantitative des gènes codant les enzymes impliqués dans la fonction dénitrifiante.
- Production bactérienne mesurée par marquage radioactif.
Sur des vasières, la variabilité temporelle de la diversité/abondance des procaryotes étant très importante (contrairement à la variabilité spatiale), il est nécessaire de répéter les prélèvements sur plusieurs jours (7) pour avoir un échantillonnage représentatif à un point donné.
- Description
-
Type de données :
Prokaryota
Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :
Abondance bactérienne
Diversité bactérienne
Quantification de la capacité dénitrifiante bactérienne
Résolution du (ou des) paramètre(s) :
3 réplicas sur une zone d’environ 100 x 100m, à 1,5 km de la côte
Fréquence d'observation :
1 prélèvement quotidien pendant 7 jours, 4 fois par an (saisonnier)
- Description
- Plan(s) d'échantillonnage : Spatial
Overviews
Spatial extent
Provided by
