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Suivi de la diversité bactérienne sur les vasières intertidales

Les vasières intertidales sont un système clé du réseau étroitement connecté d’écosystèmes qui forment la transition entre le bassin versant et le domaine océanique. Leur forte productivité est liée à l’activité d’un biofilm de diatomées, dont le fonctionnement et le devenir ont récemment fait l’objet de plusieurs programmes de recherche. En revanche, le déterminisme et le devenir de la production bactérienne associée à la sécrétion d’ExoPolySaccharides dans ce biofilm est peu connu.

Les premières études montrent pourtant que cette production est au moins équivalent à celle des diatomées. Une vision intégrée du fonctionnement écologique des vasières intertidales dans un schéma plus global des flux de carbone demande donc impérativement de décrire et quantifier le déterminisme de cette production bactérienne et son devenir dans l’écosystème.

Simple

Date (Creation)
2006-01-01T00:00:00
Identifier
FR-DCSMM-PDS-VASIREMI
Presentation form
Digital profile
Credit
Producteurs de données : UMR LIENSS 7276
Status
onGoing On going
Point of contact
  UMR LIENSS 7276 - Dupuy Christine
05 46 45 72 18
Maintenance and update frequency
Unknown
Maintenance note
Durée du réseau : réseau temporaire
Theme
  • Diversité
  • Abondance
  • Bactéries
  • Vasières
  • Intertidal
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Habitats et biotopes
Sous-regions marines
  • /Métropole/Golfe de Gascogne
DCSMM : Type d'espace concerné
  • Pas d'espace particulier concerné
DCSMM : Descripteurs
  • D4: Réseaux trophiques
  • D1: Biodiversité
DCSMM : Méthodes de recueil des données
  • Observation par point
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Habitats
Access constraints
Other restrictions
Other constraints
Accès confidentiel
Spatial representation type
vector Vector
Denominator
50000
Metadata language
Français
Character set
utf8 UTF8
Topic category
  • Oceans
N
S
E
W
thumbnail


Supplemental Information

Maître d'ouvrage :

UMR LIENSS 7276 2007-2013

Maîtres d'œuvre :

UMR LIENSS 7276 2007-2013

Financeur(s) :

ANR 2007-2011

CPER 2011-2013

Reference system identifier
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 7.9
Topology level
Geometry only
Geometric object type
Complex
Geometric object count
0
Hierarchy level
Dataset

Absolute external positional accuracy

Conformance result

Date (Creation)
2012-01-16
Explanation
Non évalué
Pass
No
Statement

Dans le sédiment :

- Diversité bactérienne obtenue par pyroséquençage (sous-traité).

- Abondance totale des procaryotes mesurée par cytométrie en flux (méthode en cours de développement).

- Quantification de la capacité dénitrifiante bactérienne obtenue par PCR quantitative des gènes codant les enzymes impliqués dans la fonction dénitrifiante.

- Production bactérienne mesurée par marquage radioactif.

Sur des vasières, la variabilité temporelle de la diversité/abondance des procaryotes étant très importante (contrairement à la variabilité spatiale), il est nécessaire de répéter les prélèvements sur plusieurs jours (7) pour avoir un échantillonnage représentatif à un point donné.

Description

Type de données :

Prokaryota

Paramètre(s) observé(s) ou mesuré(s) :

Abondance bactérienne

Diversité bactérienne

Quantification de la capacité dénitrifiante bactérienne

Résolution du (ou des) paramètre(s) :

3 réplicas sur une zone d’environ 100 x 100m, à 1,5 km de la côte

Fréquence d'observation :

1 prélèvement quotidien pendant 7 jours, 4 fois par an (saisonnier)

Description
Plan(s) d'échantillonnage : Spatial
File identifier
a6c916f3-56d1-42e7-9e68-0ab3b5800d52 XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Series
Date stamp
2025-05-15T23:38:23.388063Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  Sextant
 
 

Overviews

overview

Spatial extent

N
S
E
W
thumbnail


Keywords

Abondance Bactéries Diversité Intertidal Vasières
DCSMM : Descripteurs
D1: Biodiversité D4: Réseaux trophiques
DCSMM : Méthodes de recueil des données
Observation par point
DCSMM : Type d'espace concerné
Pas d'espace particulier concerné
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Habitats et biotopes
Thèmes Sextant
/Milieu biologique/Habitats

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