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Etude de la diversité des communautés bactériennes associées aux microalgues toxiques (Alexandrium et Ostreopsis)

Etude de la diversité des communautés bactériennes associées aux microalgues toxiques

Simple

Date (Creation)
2019-01-01
Identifier
FR-330-715-368-00032-IFR_BIOINFO_DIVBAC
Identifier
DOI:10.12770/d9b16790-d125-45d3-bcab-1241d0235b6c
Credit
Ifremer - Laboratoire Phycotoxines
Author
  IFREMER - Enora Briand
Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 , Nantes , France
02 40 37 42 94
02 40 37 42 41
Publisher
  IFREMER
GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
  • Habitats et biotopes
Thèmes Sextant
  • /Milieu biologique/Bio-Informatique
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
  • Bioinformatique
Use limitation
Donnée en accès restreint
Access constraints
Restricted
Use constraints
Restricted
Metadata language
Français
Character set
utf8 UTF8
Topic category
  • Environment
N
S
E
W
thumbnail


Reference system identifier
EPSG / WGS 84 (EPSG:4326) / 8.6
Distribution format
  • ( )

OnLine resource
/home/ref-bioinfo/ifremer/intercentres/divbac ( NETWORK:LINK )
OnLine resource
DOI du jeu de donnée ( DOI )

DOI du jeu de donnée

Hierarchy level
Dataset
Statement
Le projet DIVBAC a pour objectif d’étudier (1) la diversité structurelle des communautés bactériennes associées à deux genres de microalgues marines cultivées en laboratoire (Alexandrium et Ostreopsis). 26 souches d'Alexandrium (6 espèces) et 5 souches d'Ostreopsis (2 espèces) ont été étudiées. Ces souches, isolées depuis plusieurs années et maintenues au laboratoire PHYC en condition contrôlée, présentent une forte diversité génotypique, géographique, écologique (souches pélagiques ou benthiques) et toxinique. La diversité structurelle des communautés bactériennes associées aux microalgues en culture a été réalisée par séquençage haut-débit d’un fragment du gène codant l’ARNr 16S de ces bactéries (technologie Illumina, MiSeq ; chimie V3 ; région V3-V4 du gène codant l’ARNr16S).
File identifier
d9b16790-d125-45d3-bcab-1241d0235b6c XML
Metadata language
Français
Character set
UTF8
Hierarchy level
Dataset
Date stamp
2025-05-16T09:09:21.411722Z
Metadata standard name
ISO 19115-3 - SEXTANT
Metadata standard version
1.0
Point of contact
  IFREMER - Pepin Jean-Francois
Station de La Tremblade - Ronce Les Bains - 17390 La Tremblade , La Tremblade , France
05 46 76 26 20
05 46 76 26 11
 
 

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S
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Keywords

GEMET - INSPIRE themes, version 1.0
Habitats et biotopes
ODATIS aggregation parameters and Essential Variable names
Bioinformatique
Thèmes Sextant
/Milieu biologique/Bio-Informatique

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