Whole genome pooled sequencing of individuals from 4 populations and 3 different color phenotype in order to uncover the genetic variants linked to color expression in the pearl oyster P. margaritifera.

Metagenomic analysis of clams from Sanaga river in Cameroon to describe the virome

Ce projet s’attache à étudier les phénomènes Natech imputables à des inondations/tsunami en considérant deux échelles spatiales d’analyse : l’échelle du site industriel et l’échelle du territoire. Ces deux échelles permettent d’appréhender la problématique des Natechs d’une part d’un point de vue essentiellement « vulnérabilité » et d’autre part, grâce à une analyse plus globale et profonde qui fait résonner la notion de résilience territoriale. Le travail est basé sur une analyse a posteriori (au Japon) et a priori (en France) des pratiques de gestion des événements Natech auprès des parties prenantes (industriels, collectivités, services de l’état…). Pour cela, en France et au Japon, des questionnaires, des visites et des entretiens ont été réalisés sur des territoires touchés ou potentiellement concernés par le phénomène Natech inondation/tsunami. Ces données sont employées : -à l’échelle du site industriel, pour modéliser l’impact du phénomène naturel sur l’installation (par le biais notamment d’arbres de défaillances), puis produire deux outils d’aide à la décision (diagnostic de l’Etude de danger et diagnostic du Plan d’Opération Interne lors d’un événement Natech inondation) -à l’échelle du territoire pour modéliser le processus Natech, identifier 3 zones de fragilité, définir 5 scénarios de choc. Puis, en considérant que la résilience globale d’un territoire dépend notamment de la résilience des acteurs qui le constituent proposer un outil d’audit des parties prenantes du territoire afin d’estimer la résilience de chacun d’entre eux, les pistes de progrès et, in fine, améliorer la résilience du territoire qui les héberge. Mots-clefs : Natech, Science du danger, arbres de défaillance, aide à la décision, résilience territoriale.

The ABYSS project aims at describing deep-sea benthic biodiversity spanning several branches of the tree of life with eDNA metabarcoding tools. To accommodate both micro- and macro biologists, we designed a bioinformatic pipeline based on Illumina read correction with Dada2 allowing analysing metabarcodes from prokaryotic and eukaryotic life compartments.

scRNA-seq reads from a Pacific oyster (Crassostrea gigas) hemocyte preparation. Hemocytes were isolated from a unique immunologically naive animal (Ifremer Standardized Animal, 18 months) and single-cell drop-seq technology was applied to 3,000 individual hemocytes.

Cette étude vise à établie un état des lieux de la filière bois-forêt girondine afin d'adapter les actions du Département et sa stratégie de soutien à la filière.

2bRAD genotyping will be used to estimate genetic diversity and connectivity among populations of Sabellaria alveolata. We will relate population genetic parameters with reef state characteristics.

Frise chronologique des millésimes de modes d'occupation des sols produits par les régions françaises et par le programme Corine Land Cover.

This dataset is the coastal zone land surface region from Europe, derived from the coastline towards inland, as a series of 10 consecutive buffers of 1km width each. The coastline is defined by the extent of the Corine Land Cover 2018 (raster 100m) version 20 accounting layer. In this version all Corine Land Cover pixels with a value of 523, corresponding to sea and oceans, were considered as non-land surface and thus were excluded from the buffer zone.

Les ministères chargés de l'écologie (Meeddm) et de l'agriculture (Maap) ont confié au Gip Ecofor une mission d'expertise collective scientifique et technique à visée prospective sur « l'avenir du massif forestier des Landes de Gascogne ». Son objectif est de mobiliser la connaissance autour d'options envisageables pour assurer l'avenir du massif forestier landais et de la partager avec l'ensemble des parties intéressées. Les document disponibles sont les rapports finaux des groupes de travail et d'experts.