Metagenomic analysis of clams from Sanaga river in Cameroon to describe the virome

Extrait de l'Atlas Aquitaine, Limousin et Poitou-Charentes sur la filière forêt-bois

This dataset is the coastal zone land surface region from Europe, derived from the coastline towards inland, as a series of 10 consecutive buffers of 1km width each. The coastline is defined by the extent of the Corine Land Cover 2018 (raster 100m) version 20 accounting layer. In this version all Corine Land Cover pixels with a value of 523, corresponding to sea and oceans, were considered as non-land surface and thus were excluded from the buffer zone.

Ce projet s’attache à étudier les phénomènes Natech imputables à des inondations/tsunami en considérant deux échelles spatiales d’analyse : l’échelle du site industriel et l’échelle du territoire. Ces deux échelles permettent d’appréhender la problématique des Natechs d’une part d’un point de vue essentiellement « vulnérabilité » et d’autre part, grâce à une analyse plus globale et profonde qui fait résonner la notion de résilience territoriale. Le travail est basé sur une analyse a posteriori (au Japon) et a priori (en France) des pratiques de gestion des événements Natech auprès des parties prenantes (industriels, collectivités, services de l’état…). Pour cela, en France et au Japon, des questionnaires, des visites et des entretiens ont été réalisés sur des territoires touchés ou potentiellement concernés par le phénomène Natech inondation/tsunami. Ces données sont employées : -à l’échelle du site industriel, pour modéliser l’impact du phénomène naturel sur l’installation (par le biais notamment d’arbres de défaillances), puis produire deux outils d’aide à la décision (diagnostic de l’Etude de danger et diagnostic du Plan d’Opération Interne lors d’un événement Natech inondation) -à l’échelle du territoire pour modéliser le processus Natech, identifier 3 zones de fragilité, définir 5 scénarios de choc. Puis, en considérant que la résilience globale d’un territoire dépend notamment de la résilience des acteurs qui le constituent proposer un outil d’audit des parties prenantes du territoire afin d’estimer la résilience de chacun d’entre eux, les pistes de progrès et, in fine, améliorer la résilience du territoire qui les héberge. Mots-clefs : Natech, Science du danger, arbres de défaillance, aide à la décision, résilience territoriale.

PPRIF

This dataset presents the resulting assessment grid (based on the EEA reference grid) with the classification of chemical status of the transitional, coastal and marine waters in the context of the Water Framework Directive (WFD) and the Marine Strategy Framework Directive (MSFD). This classification has been performed using the CHASE+ tool, with classifications of the matrices ‘water’, ‘sediment’ and ‘biota’ and indicators of ‘biological effects’, as well as an integrated classification of chemical status, combining results of all matrices. The chemical status is evaluated in five classes, where NPAhigh and NPAgood are recognised as ‘non-problem areas’ and PAmoderate, PApoor and PAbad are recognised as ‘problem areas’. This is the assessment made excluding concentrations of polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) The overall area of interest used is based on the marine regions and subregions under the Marine Strategy Framework Directive. Additionally, Norwegian (Barent Sea and Norwegian Sea) and Icelandic waters (’Iceland Sea’) have been added (see Surrounding seas of Europe). Note that within the North East Atlantic region only the subregions within EEZ boundaries (~200 nm) have been included. This dataset underpins the findings and cartographic representations published in the report "Contaminants in Europe's Seas" (EEA, 2019): https://www.eea.europa.eu/publications/contaminants-in-europes-seas.

The ABYSS project aims at describing deep-sea benthic biodiversity spanning several branches of the tree of life with eDNA metabarcoding tools. To accommodate both micro- and macro biologists, we designed a bioinformatic pipeline based on Illumina read correction with Dada2 allowing analysing metabarcodes from prokaryotic and eukaryotic life compartments.

Ce jeu de données représente sous forme de polygones, les espaces situés à moins de 200m de terrains en nature de bois et forêt, appelés "zones exposées au risque feu de forêt", dont les paramètres sont précisés par l'article R133-5 du Code forestier. Ces zones sensibles au risque d'incendie de forêt comprennent les formations forestières ainsi que la zone périphérique de 200m de large les entourant. Sur cet ensemble s'applique une règlementation particulière afin d'y réduire le risque. Notamment concernant l'obligation légale de débroussaillement qui s'applique dans ces espaces, cette cartographie est annexée aux plan locaux d'urbanisme ou aux documents d'urbanisme en tenant lieu (article L134-15 du Code forestier).

Les ministères chargés de l'écologie (Meeddm) et de l'agriculture (Maap) ont confié au Gip Ecofor une mission d'expertise collective scientifique et technique à visée prospective sur « l'avenir du massif forestier des Landes de Gascogne ». Son objectif est de mobiliser la connaissance autour d'options envisageables pour assurer l'avenir du massif forestier landais et de la partager avec l'ensemble des parties intéressées. Les document disponibles sont les rapports finaux des groupes de travail et d'experts.

L’objectif général de ce projet de thèse est d’analyser et d’évaluer les données sources (actuelles et potentielles) des matrices de changements d’occupation du sol afin d’améliorer la robustesse de l’inventaire. Il s’agit d’expertiser par une démarche scientifique la pertinence des travaux réalisés annuellement pour l’inventaire UTCATF. En particulier, il s’agit de comprendre les causes des incertitudes des données sources ; compiler les données disponibles et leurs métadonnées ; étudier qualitativement les dynamiques paysagères décrites ; et redéfinir un cadre méthodologique permettant d’estimer des taux de changements plus pertinent.