Individuals from 5 populations were kept in common garden conditions in order to examine acclimation and adaptation to temperature in the honeycomb worm. Worms were exposed to 5 temperature treatments, and collected for RNAseq analysis. Gene expression patterns were then examined.

Ces travaux ont été réalisés dans le cadre de la Directive Territoriale d'Aménagement et de Développement Durable (DTADD) portée par la Préfecture de la région ex-Aquitaine. La partie I de ces travaux porte sur les valeurs du massif forestier des Landes de Gascogne. Le massif est dépositaire d’importantes valeurs et fonctions non marchandes d’intérêt général notamment : paysagères, naturalistes, hydrologiques et climatiques. Ce rapport explique également que les modes de valorisation du territoire, autres que ceux liés à la production de bois d’œuvre et d’industrie, interfèrent étroitement avec la présence même de la forêt de production : l'activité touristique, l'arrivée de nouveaux habitants et l'économie induite, ainsi que le foncier forestier.

Whole genome pooled sequencing of individuals from 4 populations and 3 different color phenotype in order to uncover the genetic variants linked to color expression in the pearl oyster P. margaritifera.

Successive infections with Vibrio harveyi were conducted in two populations of the European abalone in order to examine which genes may be involved in improved survival to the disease in the St. Malo population.

Process-driven seafloor habitat sensitivity (PDS) has been defined from the method developed by Kostylev and Hannah (2007), which takes into account physical disturbances and food availability as structuring factors for benthic communities. It is a conceptual model, relating species’ life history traits to environmental properties. Physical environment maps have been converted into a map of benthic habitat types, each supporting species communities with specific sensitivity to human pressures. It is based on two axes of selected environmental forces. The "Disturbance" (Dist) axis reflects the magnitude of change (destruction) of habitats (i.e. the stability through time of habitats), only due to natural processes influencing the seabed and which are responsible for the selection of life history traits. The "Scope for Growth" (SfG) axis takes into account environmental stresses inducing a physiological cost to organisms and limiting their growth and reproduction potential. This axis estimates the remaining energy available for growth and reproduction of a species (the energy spent on adapting itself to the environment being already taken into account). It can be related to the metabolic theory of the ecology. The process-driven sensitivity (PDS) can be seen as a risk map that combines the two previous axes and reflects the main ecological characteristics of the benthic habitats regarding natural processes. Areas with low disturbance are areas with a naturally low reworking of the sediment, allowing the establishment of a rich sessile epifauna community, with K-strategy species. Areas with low SfG means that the environmental factors, even though there are not limiting, are in lower values, i.e. that it imposes a cost for species to live. In areas combining low disturbance and low SfG, big suspension-feeder species with long life and slow growth can often be found: these species are more vulnerable in case of added disturbance.

The ABYSS project aims at describing deep-sea benthic biodiversity spanning several branches of the tree of life with eDNA metabarcoding tools. To accommodate both micro- and macro biologists, we designed a bioinformatic pipeline based on Illumina read correction with Dada2 allowing analysing metabarcodes from prokaryotic and eukaryotic life compartments.

scRNA-seq reads from a Pacific oyster (Crassostrea gigas) hemocyte preparation. Hemocytes were isolated from a unique immunologically naive animal (Ifremer Standardized Animal, 18 months) and single-cell drop-seq technology was applied to 3,000 individual hemocytes.

This dataset is the coastal zone land surface region from Europe, derived from the coastline towards inland, as a series of 10 consecutive buffers of 1km width each. The coastline is defined by the extent of the Corine Land Cover 2018 (raster 100m) version 20 accounting layer. In this version all Corine Land Cover pixels with a value of 523, corresponding to sea and oceans, were considered as non-land surface and thus were excluded from the buffer zone.

Frise chronologique des millésimes de modes d'occupation des sols produits par les régions françaises et par le programme Corine Land Cover.

Ce projet s’attache à étudier les phénomènes Natech imputables à des inondations/tsunami en considérant deux échelles spatiales d’analyse : l’échelle du site industriel et l’échelle du territoire. Ces deux échelles permettent d’appréhender la problématique des Natechs d’une part d’un point de vue essentiellement « vulnérabilité » et d’autre part, grâce à une analyse plus globale et profonde qui fait résonner la notion de résilience territoriale. Le travail est basé sur une analyse a posteriori (au Japon) et a priori (en France) des pratiques de gestion des événements Natech auprès des parties prenantes (industriels, collectivités, services de l’état…). Pour cela, en France et au Japon, des questionnaires, des visites et des entretiens ont été réalisés sur des territoires touchés ou potentiellement concernés par le phénomène Natech inondation/tsunami. Ces données sont employées : -à l’échelle du site industriel, pour modéliser l’impact du phénomène naturel sur l’installation (par le biais notamment d’arbres de défaillances), puis produire deux outils d’aide à la décision (diagnostic de l’Etude de danger et diagnostic du Plan d’Opération Interne lors d’un événement Natech inondation) -à l’échelle du territoire pour modéliser le processus Natech, identifier 3 zones de fragilité, définir 5 scénarios de choc. Puis, en considérant que la résilience globale d’un territoire dépend notamment de la résilience des acteurs qui le constituent proposer un outil d’audit des parties prenantes du territoire afin d’estimer la résilience de chacun d’entre eux, les pistes de progrès et, in fine, améliorer la résilience du territoire qui les héberge. Mots-clefs : Natech, Science du danger, arbres de défaillance, aide à la décision, résilience territoriale.