Metagenomic analysis of clams from Sanaga river in Cameroon to describe the virome

L’objectif de cette étude est d’illustrer à l’aide d’indicateurs les conséquences de choix de gestion imposés par cinq scénarios socioéconomiques prospectifs appliqués à une large zone forestière pour les 60 prochaines années. Le cas d’étude choisi est la zone centrée sur la commune de Pontenx-les-Forges dans le sud-ouest de la France et couvrant 101000 hectares. Cet article présente une description de la zone d’étude et des itinéraires sylvicoles mis en œuvre par les propriétaires forestiers selon des scénarios. À l’aide d’un simulateur pilotant deux modèles de croissance, l’évolution de la zone d’étude à l’échelle de chaque parcelle est synthétisée par 9 indicateurs sur une période de 60 ans : le volume sur pied, le carbone sur pied, le volume total exploité, la valeur commerciale sur pied, le volume de l’arbre moyen, la vulnérabilité au vent et au feu, et des indices de biodiversité. Un des principaux résultats de cette étude est de montrer l’amplitude des changements pour la production et le volume sur pied : selon les scénarios les récoltes annuelles peuvent varier de 50 % dès 2030. Par conséquent, d’autres indicateurs sont impactés comme la biodiversité, la vulnérabilité au vent ou au feu. Pourtant, l’espèce dominante est maintenue et le comportement partiellement conservateur des types de propriétaires est pris en compte. En conclusion, des améliorations pour de futures simulations sont envisagées ; dans ce but, des synergies avec la télédétection sont nécessaires pour la collecte des données d’initialisation sur de larges territoires, ce qui permettra d’améliorer la précision des résultats.

Successive infections with Vibrio harveyi were conducted in two populations of the European abalone in order to examine which genes may be involved in improved survival to the disease in the St. Malo population.

La Région Nouvelle-Aquitaine accompagne les acteurs publics et privés dans leur transition énergétique et écologique à l'horizon 2030. Avec ses 11 ambitions, la feuille de route Néo Terra guide l'action régionale et celle de ses partenaires pour la mise en œuvre d'actions concrètes. Un engagement collectif pour la Nouvelle-Aquitaine de demain.

The maps show the network of protected marine areas (AMP) in mainland France, used to inform users of sea conditions and to inform authorities via display boards in port offices or any other public location. A protected marine area is a defined area at sea intended to protect the natural environment on a long-term basis. The list of protected marine areas is not exhaustive and not all such areas are visible due to the chart scale.

This dataset presents the resulting assessment grid (based on the EEA reference grid) with the classification of chemical status of the transitional, coastal and marine waters in the context of the Water Framework Directive (WFD) and the Marine Strategy Framework Directive (MSFD). This classification has been performed using the CHASE+ tool, with classifications of the matrices ‘water’, ‘sediment’ and ‘biota’ and indicators of ‘biological effects’, as well as an integrated classification of chemical status, combining results of all matrices. The chemical status is evaluated in five classes, where NPAhigh and NPAgood are recognised as ‘non-problem areas’ and PAmoderate, PApoor and PAbad are recognised as ‘problem areas’. The overall area of interest used is based on the marine regions and subregions under the Marine Strategy Framework Directive. Additionally, Norwegian (Barent Sea and Norwegian Sea) and Icelandic waters (’Iceland Sea’) have been added (see Surrounding seas of Europe). Note that within the North East Atlantic region only the subregions within EEZ boundaries (~200 nm) have been included. This dataset underpins the findings and cartographic representations published in the report "Contaminants in Europe's Seas" (EEA, 2019): https://www.eea.europa.eu/publications/contaminants-in-europes-seas.

In European sea bass like in other animals, the tongue plays a fundamental role in the mechanics of food ingestion. It is composed from the surface in depth of mucosa, submucosa, musculature and fibro cartilaginous skeleton. The tunica mucosa exhibits a stratified epithelium interrupted by numerous teeth differently distributed that erupt more or less completely from the layers below. The European sea bass tongue is composed of canine-like teeth, surrounded by taste buds and numerous fungiform and conical papillae. The tongue beeing directly in contact with external environment, the success of the adaptation of fishes to different environments in the context of global change, depends oamong other on the modifications occurring on the tongue structures. The present study investigates the potential effect of ocean acidification on the lingual transcriptome.

ddRAD genotyping was used to evaluate population connectivity and putative loci under selection in honeycomb worm from 13 sites spanning its distribution in the Atlantic and Mediterranean coasts.

Larvae from Pacific oyster, Manila clam, European abalone and great scallop were subjected to two temperatures and two pH over the course of early development. RNAseq data was collected in order to evaluate which genes are modulated in response to stress.

2bRAD genotyping will be used to estimate genetic diversity and connectivity among populations of Sabellaria alveolata. We will relate population genetic parameters with reef state characteristics.